Главная > На экране > Международная команда под руководством российских ученых разработала систему OncoFinder для анализа транскриптомных данных

Международная команда под руководством российских ученых разработала систему OncoFinder для анализа транскриптомных данных

Международная команда под руководством российских ученых разработала систему OncoFinder для анализа транскриптомных данныхДля анализа экспрессии генов используются аналитические методы секвенирования и микрочипирования. Однако используя их с большой вероятностью можно получить ошибочные результаты на разных стадиях приготовления образцов, анализа и обработки полученных данных. Российские ученые предложили уникальный биоинформатический инструмент для математического анализа внутриклеточных сигнальных путей OncoFinder, который поможет провести количественный анализ функциональных изменений внутри клетки и свести к минимуму ошибки экспериментальных приборов. Данные об этом будут опубликованы в журнале Frontiers in Molecular Biosciences в Августе 2014 года.

Алгоритм OncoFinder может считывать и обрабатывать большой объем внутриклеточных сигналов. Известно, что любые изменения клетки сопровождаются активацией множества сигнальных путей. Именно они определяют все основные процессы в клетке: рост, дифференцировку, пролиферацию, миграцию, жизнедеятельность, превращение в опухолевую клетку и клеточную смерть. На основе транскриптомных данных OncoFinder дает количественную и качественную характеристику активации сигнальных путей и сравнивает эти показатели с нормой. Этот биоинформатический инструмент позволяет с большой точностью отслеживать любые функциональные изменения внутри клетки.

Группа ученых под руководством доктора биологических наук, заведующего лабораторией в ФНКЦ Детской Гематологии, Онкологии и Иммунологии им Д. Рогачева, Антона Буздина решила провести эксперимент и сравнить данные экспрессии генов одинаковых биологических образцов, полученных на секвенаторе последнего поколения и методом микрочипирования. В результате эксперимента было доказано, что результаты экспрессии отдельных генов имеют слабую корреляцию. Напротив, данные экспрессии генов объединенные в сигнальные пути полученные с помощью OncoFinder, имеют высокую корреляцию с данными секвенирования последнего поколения и микрочипирования. Это означает, что OncoFinder значительно уменьшает ошибки экспериментальных приборов для широкого анализа транскриптома и может стать незаменимой методикой для биоинформатики, молекулярной диагностики и медицины.

В разработке и валидации методики OncoFinder приняло участие более пятидесяти ученых из различных организаций включая группы Николая Борисова (ФМБА России), Сергея Румянцева (ФНКЦ ДГОИ, МФТИ), Александра Алипера (МГУ), Андрей Гаража (МФТИ), Михаила Корзинкина (МИФИ), Николая Жукова (МИОИ им. П.А.Герцена), Ольги Ковальчук (Альберта, Канада), Чарльза Кантора (Бостонский Университет), коллектив Чинсонга Жу (Университет Джонс Хопкинс), Александра Жаворонкова (ФНКЦ ДГОИ, МФТИ). По словам ученых, технология OncoFinder может применятся не только для сравнения транскриптомных данных полученных с помощью разных платформ и подбора таргетных препаратов в персонализированной медицине рака, но и в других заболеваниях, а также для предсказания эффективности различных препаратов и их комбинаций для лечения возраст-зависимых заболеваний.

Президент фонда поддержки молодых ученых УМА Анна Чапман прокомментировала это исследование: «На данный момент методика анализа облака сигнальных путей OncoFinder является уникальной возможностью сделать диагностику сложных онкологических заболеваний более точной и улучшить принятие решений при подборе таргетных препаратов для каждого конкретного случая. Я горжусь тем, что всемирно значимое научное достижение, сделанное именно российскими учеными, станет в дальнейшем незаменимым для каждой научно-исследовательской лаборатории во всем мире. Фонд УМА также помог с оплатой редакции статьи носителями языка для увеличения шансов принятия данных к публикации в хорошем журнале, который предоставляет научные статьи в открытом доступе».

Более подробно о методике OncoFinder можно будет узнать на форуме в городе Базель (Швейцария) 23-24 сентября, который собираются посетить более 3,500 представителей фармацевтических компаний и крупнейших исследовательских институтов со-организатором которой является Александр Жаворонков (ФНКЦ ДГОИ, МФТИ). Регистрация на мероприятие бесплатная, подробную информацию о мероприятии можно найти на сайтax www.AgingPharma.org и www.miptec.ch.

Самая эффективная отраслевая выставка China Kids Expo 2014 пройдет в Шанхае

Зарубежные покупатели товаров для детей могут подать заявку на бесплатное проживание в гостинице на протяжении трех дней проведения выставки China Kids Expo 2014, которая состоится с 14 по 16 октября в Шанхае. Площадь проведения China Kids Expo и сопутствующих мероприятий была расширена более чем на 30 процентов — до 120 000 квадратных метров. По прогнозам, в мероприятии примут участие 1 300 экспонентов и 80 000 посетителей со всего мира.

Организаторы шоу приглашают всех зарубежных покупателей посетить самую профессиональную и эффективную отраслевую торговую платформу в Китае. Для одобрения заявки на бесплатное проживание в гостинице все заинтересованные импортеры, дистрибьюторы и сетевые ритейлеры должны до 31 августа пройти процедуру предварительной онлайн-регистрации и обратиться к организатору выставки для подтверждения профиля.

По состоянию на конец июля число зарубежных посетителей выставки, прошедших предварительную регистрацию, составляло на 200 процентов больше, чем в прошлом году. Среди ведущих ритейлеров, зарегистрировавшихся для участия в мероприятии, представлены такие гиганты, как Carrefour, Home Retail Group и Kmart.

Китайские производители-экспортеры достигают новых высот, с уверенностью участвуя в сорсинге продукции

По состоянию на сегодняшний день, число новых экспонентов на выставке 2014 года достигло 60 процентов, среди которых 84 процента — это китайские производители. Осуществлять экспорт в этом году готовы 88 процентов китайских экспонентов. Эти производители, вне зависимости от своих размеров и масштабов деятельности, принимают зарубежные заказы, отличаются высокой надежностью и имеют необходимый потенциал для реализации инноваций и обеспечения контроля качества. Другими словами, они способны удовлетворить самые разнообразные требования и запросы мировых покупателей.

Торговые марки детских колясок, автомобильных кресел и велосипедов продолжают лидировать на всех выставках товаров для детей

Крупнейшие базы производства детских колясок, велосипедов и автомобильных кресел – Куньшань, Нинбо, Пинху, Циси в Восточном Китае, Чжуншань, Дунгуань на юге КНР и Пинсян в северной части страны, — ежегодно организуют участие местных фабрик в этой выставке, что делает ее идеальной сорсинговой платформой для международных покупателей. И, что более важно, многие из этих производителей впервые выставляют свою продукцию на выставке такого масштаба. China Kids Expo – это единственное специализированное торговое шоу в Китае, где можно увидеть все.

Выставка, организуемая совместно CTJPA и Kolenmesse, проводится на ежегодной основе в китайском мегаполисе Шанхае, одновременно с China Toy Expo – крупнейшей на материковой части Китая выставке игрушек, — и China Licensing Expo.

 

У побережья Флориды гигантский окунь с первого раза проглотил акулу

У побережья Флориды гигантский окунь с первого раза проглотил акулуВ сети появился видеоролик, на котором местные рыбаки засняли как морской окунь громадных размеров в один момент проглотил акулу. Произошло это в тот момент, когда рыбаки пытались втащить на судно акулу, полутора метров в длину, которая попалась на удочку. Окуни — груперы таких просто гигантских размеров в США не редкость. Взрослые экземпляры достигают массы в 400 кг. По информации из флоридского музея естествознания гигантские груперы находятся на грани вымирания. За последнее десятилетие их численность сократилась почти на 80%.

В Instagramе запустили новые инструменты для рекламодателей

В Instagramе запустили новые инструменты для рекламодателейТеперь социальном сервис Instagram может показать статистику пользователей, среагировавших на таргентированную рекламу. Рекламодатели, которые будут раскручивать свой продукт с помощью Instagram, смогут видеть такие показатели, как показы, охват аудитории, конверсии платной рекламы и др.

Instagram это детище Facebook. Здесь также как и в Facebook рекламодатели могут учитывать данные не только по конкретным объявлениям, а по странице (аккаунту) в целом. По всем этим данным можно дать оценку популярности бренда среди пользователей Instagram.

Но самое интересное новшество – возможность отследить показатели рекламных фото в реальном времени. Эта функция позволяет сразу протестировать рекламное размещение, отследить реакцию пользователей на фото или видео, а также понять в какое время суток лучше всего запускать рекламу.

Ученые уверены, что рак желудка можно вылечить ботоксом

Ученые уверены, что рак желудка можно вылечить ботоксомГруппа ученых из Норвежского Университета совместно с учеными из Университета Колумбии выяснили, что уколы ботокса могут довольно эффективно бороться с раком желудка. По результатам стало ясно, что средство против морщин, которое так популярно среди кинозвезд и представителей шоу – бизнеса, значительно замедляет рост онкоопухолей, блокируя при этом нервные сигналы, стимулирующие онкоклетки.

Первый этап опытов на грызунах закончился. Теперь в Норвегии стартуют следующие клинические испытания, участвуют в них люди, страдающие от недуга. Ученые ботокс в организм будут вводить локально с помощью гастроскопии. Известно, что ботоксные инъекции гораздо дешевле, и менее токсичны нежели другие препараты, используемые в борьбе с онкозаболеваниями, к тому же в нем нет побочных эффектов.

В ходе опытов ученые изучали действие уколов ботокса на рак желудка в ранней стадии. В будущем ученые выяснят, можно ли так излечить онко на поздних стадиях.

Новгородские пенсионеры обучаются дистанционно компьютерной грамотности

Новгородские пенсионеры обучаются дистанционно компьютерной грамотностиК началу учебного года активно готовятся школьники и студенты, и люди преклонного пенсионного возраста. Полтысячи пенсионеров региона планируют бесплатно обучаться компьютерной грамотности в региональном отделении центра ОПФР «Союза пенсионеров России».

Многим новгородцам по состоянию здоровья не добраться самостоятельно до места, где проходят курсы, но они очень просили отыскать альтернативный вариант обучения. Организаторы нашли его – это дистанционное обучение. В этом году впервые организована группа для инвалидов.

В конце сентября, кстати, в Москве пройдет среди пенсионеров чемпионат по компьютерному многоборью. От Новгородской области на нем будут выступать победители регионального конкурса, они выпускники подобных курсов.

Патрик Стюарт предпочел участию в ледяном Ice Bucket Challenge стакан виски

Патрик Стюарт предпочел участию в ледяном Ice Bucket Challenge стакан вискиИменитый актер Патрик Стюарт из Великобритании присоединился к благотворительном онлайн Ice Bucket Challenge, и сделал он это весьма в незаурядный способ. Патрик не как все, он не окатил себя ледяной водой, а, молча, выписал чек на 100 баксов для ALS Association. Цель которого — борьба боковым амиотрофическим склерозом. Далее, все так же храня молчание, бросил в стакан парочку кубиков льда, налил виски и молча, выпил его. Стюарт не произнес имени своего последователя, кому бы он хотел передать эту мокрую ледяную эстафету.

Ученые знают, чем питался и сколько пил спиртного король Англии Ричард III

Ученые знают, чем питался и сколько пил спиртного король Англии Ричард IIIГеологическая служба из Великобритании и ученые из университета Лестера исследовали останки английского короля Ричарда III, который жил в конце XV столетия, и сделали вывод, что монарх боролся со стрессом от правления страной с помощью алкоголя.

К таким выводам экспертов подтолкнули итоги изучения состояния зубов и костей английского короля. Предполагается, что правитель выпивал примерно по одной бутылке вина ежедневно, после восхождения на трон в 1483 году.

На основании изучения фрагментов, взятых из останков бедренной кости, ребер и останков зубов, которые найдены в Лестере в 2012 году в ходе раскопок, стало известно, что Его Величество употребляли в пищу лебедей, некоторые виды пресноводной рыбы, такой, к примеру, как щука, и выпивал в день до трех литров спиртных напитков.

В Великобритании умер режиссер и актер Ричард Аттенборо

В Великобритании умер режиссер и актер Ричард Аттенборо90 – летний Ричард Аттенборо ушел из жизни. Это сообщение сделал сын режиссера Майкл. Лорд Аттенборо отдал индустрии кино 60 лет. Вначале он — ведущий британский актер, а после успешный кинорежиссер. Лорд приложил руку к десяткам фильмов, но самыми известными остаются «Парк юрского периода», легендарный «Доктор Дуллитл».

Аттенборо обладал множеством наград, среди них «Золотой глобус», «Оскар». Громкий успех пришел к Аттенборо после постановки и продюсирования киноработы «Ганди» 1982 года.

Шесть лет назад актер упал с лестницы. С того времени Ричард практически не вставал с постели, редко пользовался инвалидным креслом. Режиссер с супругой жили в доме для престарелых.

Также семья Аттерборо известна своим участием в волонтерской программе «Киндертранспорта» в 1939 году. Они приняли в дом к себе двух девочек – евреек, тем самым сохранив малышкам жизнь.

В Казани открылся музей игровых автоматов времен СССР

В Казани открылся музей игровых автоматов времен СССР

Уникальные игры

Частный музей игровых автоматов недавно открылся в Казани. Экспонаты музея собирались по всей нашей родине. Они восстановлены из оставшихся в парках Горького игровых аппаратов. Получается, что вместе с музеем социального быта, в городе это 2 — я выставочная площадка, которая показывает достижения доперестроечной эпохи. Прессе удалось узнать, что стоимость этой экспозиции равна пяти миллионам рублей.

В казанском музее азартных игр советской эпохи собраны более сорока таких уникальных аппаратов, как «Морской бой», «Магистраль», «Баскетбол», «Городки», «Воздушный бой», «Подводная лодка», «Снайпер» ,«Хоккей» и много чего интересного.

Стоимость билета – 350 рублей. Посетители музея игровых автоматов  получают горсть монет номиналом 15 копеек, и могут поиграть на более чем десяти автоматах. По словам организаторов, ежемесячно уходит по несколько килограммов монет – посетители попросту забирают их с собой как сувениры.

Поиграть и выпить вод

В музее есть автомат с газированной питьевой водой в дополнение с граненым стаканом, а также аппарат для разлива кваса. По словам одного из создателей музея, они нашли в столице на заводе «Очаково» газировку по ГОСТу, какой был еще в советские времена. «Вкус детства» или нет, сказать довольно сложно, ведь человеческая память меняется с годами. В музее представлен уникальный аппарат по разливу кваса. Ранее, заметил создатель музея, за игровыми автоматами стояла трехсот литровая бочка, скрытая от взоров посетителей. Сегодня советская технология по разливу кваса уже потеряна, поэтому его разливать будут при помощи кэг.

Почему Казань?

К Казани предприниматели присматривались довольно давно, ведь аналогичный музей уже 7 лет работает в Москве, а в 2013 году открылся филиал в Питере, который с успехом работает. Популярность заведения обосновывается еще и удачным его расположением.

Сама идея создания такого музея родилась у трех москвичей, когда они еще студентами были. Сначала они отыскали «Морской бой», игровой автомат — мечта советского мальчишки, и восстановили его для себя, но очень быстро поняли, что нужно в срочном порядке открывать музей СССР игровых автоматов, ведь уже через пару лет эти раритеты канут в лету. В 2007 году они и запустили первый свой проект.

Для современников

В век технологий большинство граждан отдают предпочтение онлайн – играм, но никто не откажется вернуться в прошлое, чтобы снова попытать счастье на одном из отреставрированных раритетных автоматов.

Но все же если вам захотелось попытать удачу и утолить жажду игрового азарта в современных азартных слотах стоит попробовать игровые автоматы Вулкан. Тем более, что не нужно куда – либо ехать или искать казино, в этом онлайн – казино можно комфортно играть, находясь дома. В виртуальном клубе представлено широкое разнообразие азартных развлечений, с бонусами и своевременными полными выплатами.

Для приобретения пакета недвижимости на Кипре необходимо всего лишь два документа

В двойном гражданстве есть целый ряд преимуществ, особенно для тех, кому постоянно требуются визы для выезда за рубеж.

Республика Кипр – европейская страна, третий по величине остров в Средиземном море – предлагает шесть вариантов получения гражданства. Однако наиболее эффективным и наименее рискованным для инвестора эксперты считают приобретение пакета недвижимости на сумму не менее 5 миллионов евро. Это может быть одно или несколько строений, но не земля без каких-либо объектов недвижимости. Подробности на сайте www.passport-cyprus.com

Важно отметить, что период инвестирования требуемой суммы должен быть не менее трёх лет, а изъятие средств до окончания данного срока может повлечь аннулирование гражданства.

Для тех, кто решил стать гражданином Республики Кипр путём инвестирования в недвижимость, процесс получения нового паспорта займёт около трёх месяцев. А для приобретения пакета недвижимости необходимо всего лишь два документа – договор купли-продажи и свидетельство о собственности на объекты недвижимости.

По материалам: Компании Henley & Partners —международного лидера в сфере стратегического планирования, инвестиционных проектов, приобретения, строительства и управления недвижимостью по всему миру. Компания выступает в качестве основного советника правительств иностранных государств по разработке и внедрению программ получения инвестиционного гражданства. Концепция получения вида на жительство и иностранного гражданства была создана Henley & Partners в 1990-х гг. Офисы компании расположены в 22 странах мира, в том числе, в Лондоне, Цюрихе, Сент-Китсе и Невисе, Антигуа и Барбуде, Мальте, России. Сегодня в офисах компании по всему миру работает более 600 сотрудников.